有条件的连锁企业，甚至还可以享受他们的APP以及网上售药的平台。经营费用从费用上看，加盟药店可能比自营药店花更多的钱。虽然被加盟方会为你提供各种指导，但这些都是建立在金钱的基础上。选择加盟的话，加盟门店要付给总店不菲的加盟费和品牌使用费，可能后期还有管理费之类的费用，长年积累也是一笔不小的开支。而自营模式则省去了这一大笔费用，如果想要节约费用的话，自营模式或许是更好的选择。
何况单体药店经营成本比较低，相对连锁药店的一个单店来说，单体药店的人力成本远低于连锁药店。经营模式如果条件允许，加盟药店会提供一些专业的销售方案。他们活动做得多，经常会有一些促销打折的活动，而且有的药品价格特别低。此外，加盟药店能得到更多的商家培训机会，分享专业的药品信息和销售技巧等。而自营药店在这方面往往力不从心，只能自己摸索经营策略，适时调整经营方法，在人员招聘、工资待遇调整方面也有一定优势。
店面面积加盟或自营，店面大小也是一种考虑。小店面本身运营成本相对较低，在同样的加盟费下，大店面似乎加盟更有优势，药品的品类可以更丰富。而连锁店也有自己的苦衷，增加加盟店会导致经营成本大幅上升。譬如：增加配送车辆和人员势必会增加药品配送成本，同时为了保证有足够的药品配送，势必要增加药品储备，从而增加药品的仓储面积和养护成本。
而这些新增的成本肯定要在药价上平摊。店面位置如果在市区开店，市场竞争大，追求品牌的消费者相对明显，选择加盟则有一定的优势。如果在乡镇开药店，加盟的效益则相对不够突出。在偏远的乡镇开药店，不仅会发掘出一块属于自己的市场，而且还可以避免与连锁药店正面撞击。但另一方面，农村药店进货难，也将造成经营成本的增加。
此外，连锁店找加盟商，也会考察店面位置，往往一些地段较好、没有不良经营历史且效益较好的单店才能入他们的眼线，但这样的优良单店往往不愿加盟。市场效应近年来，药店数量的急剧扩张，不管单体还是连锁都有自己的发展思路。单体药店对零售市场的反应其实更快，单体店从决策到执行往往迅速。连锁药店如果管理不善，不能使总店决策在门店迅速执行，那么连锁药店在此方面的竞争力就不如单体店。
固然连锁药店是药品零售业的大势所趋，但单体药店也有足够的生存空间，问题在于，如何找到合适的定位和服务群体，避开连锁的优势而建立自身的市场。找到固定的服务群后，特色化的服务手段可为单体药店增光添彩。单体药店要生存，特色化服务是可行之道。所以，单体店应想方设法提高服务质量，抓住消费者的心。自身优势俗话说，外行看热闹，内行看门道。
