但过程因拒绝帮影星胡蝶携带三十多口行李箱子发生误会；又当时国民政府军统局长戴笠对有夫之妇的胡蝶情有独钟，胡蝶在成为戴笠情妇之际，向戴笠抱怨因运送行李与杨惠敏发生的私人过节。所以权倾一时的戴笠便下令将杨惠敏关进监狱，并安上了“日本间谍”的罪名。一直到1946年3月，戴笠因座机撞山死亡之后，杨惠敏才悄悄获释，从27岁到31岁，杨惠敏坐了大约4年的冤狱。
(老年杨慧敏）1946年杨惠敏获释后曾回江苏镇江老家，杨惠敏在战后跟随老蒋撤退至台湾，定居台北。33岁时经介绍后与年过花甲丧偶的台大体育教授朱重明结婚，育有二子朱复圭与朱复轰，先后曾任职于台北女师专（今台北市立教育大学）、金瓯商职（今台北市私立金瓯女子高级中学）与中国文化大学等学校。其二子朱复轰表示，母亲杨惠敏在经过4年无妄的牢狱之灾后，身心受创甚重，郁郁寡欢。
出狱后不久就来到台湾。到了台湾因为不想被人认出来，所以就低调的到学校去当代课老师，隐姓埋名（改名为杨希贤），绝口不提往事，也坚决不愿意接受国民政府的任何救济。其子也是在杨惠敏过世后，才从她好友转述下，知道了杨惠敏冒死送旗以及冤狱等事迹及原由。1975年电影《八百壮士》放映之后，看到自己送旗的故事被放上了大银幕，这才逐渐从阴影中走出来，重拾对生活的乐趣。
除了拍摄电影宣传，抗日纪念活动的故事主题摊位介绍之外，杨惠敏大儿子朱复圭表示曾向台湾当局询问其母有无拿过奖章或谁可决定补偿，未能得到答复。（1975年版《八百壮士》）1977年10月28日，杨惠敏在台北不幸遇车祸，虽经抢救保住性命，但从此左半身不能动弹，连吃饭也困难，缺乏生活自理能力。1992年2月间，因突发的脑溢血中风而卧病在床，神智模糊，后于1992年3月9日病逝于台北荣民总医院，享寿77岁。
2009年3月7日，台湾当局成立专案小组，自巴布亚新几内亚迎回海外阵亡将士英灵总牌位，并主持春祀。其中包含国军第六十七师200团吴坤上尉、新30师孔宪章上士、曹友生上士，以及当地从事抗日活动而被捕民众梁有年、陈纬南，共计256位英灵正式入祀圆山忠烈祠。根据在当地新挖掘到的广东劳工死亡纪念碑记载，共有636员死亡，其它受难者尚无下落。
居住在台湾省的八百壮士当事人，名为厉鼎新，当年为传令班中士班长，确是当时隶属当时国军71军88师部队中编制人员。厉鼎新先生于2013年7月21号在花莲去世，享年九十二岁。2010年12月16日下午5时，“八百壮士”中的一名幸存士兵杨养正因肺部严重感染及心脏衰竭，在重庆解放军第三军医大学附属新桥医院逝世。
