而在斯大林战前的大肃反、大清洗中，富有战斗经验的中高层指挥员几乎全部被撤换，新上来的指挥员根本无力驾驭一场现代化的战争。这导致，本来具有装备技术优势的苏军退化到和芬兰军队同一量级的程度。但即便如此，芬兰也难以凭一己之力对抗苏联，毕竟体量上的巨大差距不是单靠勇敢就能抹平的。战争爆发三个月后，芬兰军队已濒于兵员枯竭、弹尽粮绝的险境。
1940年3月，芬兰政府被迫和苏联签署了《莫斯科和平协定》。在协定中，芬兰丧失了1/10，即4万多平方公里的领土，包括10%的耕地，1/5的工业产值，占芬兰总人口12%的人丧失了家园被遣送。芬兰维堡、雷巴奇半岛，芬兰湾中四个岛屿被迫割让给苏联，汉科半岛租借给苏联作为海军基地，租借期30年。理论上的苏芬战争以芬兰战败告终，但在这场战争中，苏联也遭受了重创，称之为惨胜也不为过。
短短三个多月的战争，苏军以泰山压顶之势前来，但其阵亡、失踪人员高达11万人，另有18万人受伤、5.8万人患病以及五千多人被俘（苏联解体后，俄罗斯公布的数据）。以至于直到现在，芬兰老兵都经常自夸：“倒下一名芬兰士兵，要拿十个红军的命来换！”难怪战争结束后，一位苏联红军将领悲痛地说：“在这场战争中，我们得到了5.7万平方公里的土地，这足够埋葬我们牺牲的战友了。
”同时，悍然进攻一个主权国家也让苏联的形象大受影响。苏芬战争爆发后，整个西方世界都对苏联表示了谴责，并将苏联开除出国联。苏军统帅华西列夫斯基将军，事后也不得不承认：“芬兰战争是我们的一大耻辱，它败坏了我军在国内外的形象，许多事情都需要作出交待。”苏芬战争的另一个结果是，希特勒惊喜的发现，被他无比忌惮的苏联红军就是这么个成色，远远无法跟他麾下的德国国防军相比。
红军在苏芬战争中的拙劣表现，反倒让他坚定了入侵苏联的信心。此外，领土惨遭割让的芬兰也成了德国的隐形盟友，至少在共同对付苏联问题上达成了一致。1941年6月，德国撕毁《苏德互不侵犯条约》，实施了早就拟定好的“巴巴罗萨”计划，以雷霆万钧之势入侵苏联。在德国身边的小伙伴里，除了匈牙利、罗马尼亚、保加利亚等国以外，还有芬兰军队的身影。
德芬联军对苏军展开了猛攻，截至1941年8月，芬兰军队已经全部收复在冬季战争被夺去的领土。这场与二战同步的战争，芬兰将其称为“继续战争”，认为它是苏芬冬季战争的延续和一个组成部分。而苏联则认为，这是德国入侵苏联的“卫国战争”的一部分。不管如何界定“继续战争”，这场战争和苏联入侵芬兰的冬季战争具有因果关系是显而易见的。
